Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx21Q3UR97 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms