Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbm20Q3UQS8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms