Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shisa3Q3UPR0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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