Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgef40Q3UPH7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arhgef40Q3UPH7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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