Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CrxosQ3UL53 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms