Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smu1Q3UKJ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318 ms