Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms