Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms