Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm648Q3UJ22 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm648Q3UJ22 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm648Q3UJ22 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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