Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp8Q3UD82 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Parp8Q3UD82 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms