Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LbrQ3U9G9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LbrQ3U9G9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms