Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cops9Q3U898 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms