Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hectd3Q3U487 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms