Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms