Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc9Q3U0M1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms