Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl4Q3TZA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl4Q3TZA2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms