Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms