Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TchpQ3TVW5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms