Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccndbp1Q3TVC7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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