Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc136Q3TVA9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms