Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q3TTJ4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms