Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms