Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp39Q3TIX9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms