Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms