Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prr27Q3SYJ2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prr27Q3SYJ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms