Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccbe1Q3MI99 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms