Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rspo3Q2TJ95 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms