Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp1aQ2LKU9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp1aQ2LKU9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms