Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms