Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd300lgQ1ERP8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd300lgQ1ERP8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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