Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo3bQ1EG27 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo3bQ1EG27 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms