Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cers3Q1A3B0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms