Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b1Q148W0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b1Q148W0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.3 ms