Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gli2Q0VGT2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gli2Q0VGT2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms