Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtel1Q0VGM9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtel1Q0VGM9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms