Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col19a1Q0VF58 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col19a1Q0VF58 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms