Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms