Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SctQ08535 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SctQ08535 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SctQ08535 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SctQ08535 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms