Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms