Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gata4Q08369 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms