Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad51Q08297 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms