Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col9a2Q07643 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms