Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nfe2Q07279 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nfe2Q07279 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms