Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdf3Q07104 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms