Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CluQ06890 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CluQ06890 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CluQ06890 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CluQ06890 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CluQ06890 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms