Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp2Q06649 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms