Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnal1Q05A62 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnal1Q05A62 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms