Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprgQ05909 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprgQ05909 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms