Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fmn1Q05860 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms