Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms